Компьютерная томография. Программы для анализа и разметки компьютерных томограмм в стоматологии.

Обзор программ для анализа КЛКТ.


Рентгенография в стоматологической практике.

В современной стоматологии наиболее информативный метод исследования - рентгенографический.
До сих пор основными методиками рентгенологического обследования пациентов являются – ортопантомография и внутриротовая дентальная рентгенография, только на смену пленочным методам приходят цифровые датчики. Цифровая панорамная рентгенография (ортопантомография) и радиовизиография зубов в обязательном порядке входят в стандарт диагностического обследования первичных пациентов при составлении плана лечения и наблюдения в динамике больных в любом разделе амбулаторной стоматологической практики.
Применение цифровых методов рентгенодиагностики позволяет обеспечить радиационную безопасность для пациентов, медицинского персонала и населения в амбулаторной стоматологической клинике любой формы собственности. Использование компьютерных программ обработки изображения дает возможность создания, хранения и обновления архива электронных карточек пациентов, анализа по данным рентгенограмм анатомических особенностей и выявления патологических изменений в случае дифференциальной диагностики заболеваний и повреждений зубов, челюстей височно-нижнечелюстных суставов, верхнечелюстных пазух различного генеза и происхождения в любом возрасте пациентов.

Алгоритм обследования пациентов в стоматологической клинике:


· Панорамная рентгенография всего зубного ряда (ортопантомография) всем первичным пациентам,
· Внутриротовая прицельная рентгенография зубов и периапикальных тканей (цифровая на радиовизиографе или пленочная на дентальном рентгеновском аппарате),
· Контрольная ортопантомография в динамике после проведения различных видов лечения по назначению врача-стоматолога,
· Трехмерная дентальная компьютерная томография для дифференциальной диагностики заболеваний зубочелюстной системы, челюстно-лицевой области, верхнечелюстных пазух и височно-нижнечелюстных суставов.
Анализ клинического материала показывает, что использование в различных разделах амбулаторной стоматологической практики трехмерного дентального компьютерного томографа дает возможность получить следующие результаты:
· Терапия: позволяет провести дифференциальную диагностику осложнений кариеса зубов и определить оптимальную методику и тактику эндодонтического лечения, оценивать результаты терапевтического лечения в динамике;
· Хирургия: позволяет проводить планирование зубной имплантации (с шаблонами или без) и дальнейшего ортопедического лечения, дает возможность прогнозировать и оценивать отдаленные результаты имплантации у пациентов различных стоматологических клиник;
· Ортопедия: проводить оценку результатов ортопедического лечения стоматологических пациентов;
Детская стоматология и ортодонтия: выявляет аномалии развития и расположения зубов; позволяет планировать ортодонтическое лечение на основании использования цефалометрических данных и проводить оценку результатов данного лечения в динамике;

Возможности компьютерной томографии.


Зачем Вам делать компьютерную томограмму?
Только компьютерная томография позволяет выявлять патологические изменения со стороны альвеолярных отростков челюстей, верхнечелюстных и околоносовых (лобные пазухи, клетки решетчатого лабиринта, основная пазуха) пазух, изменения носовой перегородки, наружного слухового прохода, среднего и внутреннего уха, височной кости, нижнечелюстных каналов, височно-нижнечелюстных суставов, планировать и оценивать в динамике оперативные вмешательства в челюстно-лицевой хирургии, хирургической стоматологии и оториноларингологии.


Таким образом, практическое применение дентальной объемной томографии значительно расширяет диагностические горизонты оценки анатомических особенностей и патологических процессов зубочелюстной системы. При этом трехмерная диагностика способствует повышению качества лечения во всех разделах амбулаторной стоматологической практики, челюстно-лицевой хирургии и оториноларингологии.

КЛКТ. Конусно-лучевая компьютерная томография.


Ценность современного метода конусно-лучевой компьютерной томографии в огромном массиве данных, который записывается в файлы формата DICOM компьютерным томографом. После получения данных КЛКТ стоматолог - имплантолог должен его правильно интерпретировать, обладая достаточной квалификацией врача рентгенолога, так же умозрительно представляя себе предстоящую операцию, а врач-ортопед рассчитывать правильность финальной ортопедической конструкции. Таким образом, чтобы имплантат был установлен в позицию удобную и физиологичную для последующего протезирования. Для этого применяется специализированные программы, при помощи которых производится расчёт многослойных реконструкций (Multiplanar reconstruction (MPR)).

Коммерческое программное обеспечение.


В стоматологии в частности, и в медицине в целом, эта область все еще очень слабо развита и не достигла современного уровня по сравнению, например с 3D-графикой, несмотря на то, что это очень близкие направления алгоритмах обработки данных.

Каждый разработчик программного обеспечения для медицины, априори считает врача слабоумным идиотом, и это ложится в основу всей философии разработки программного обеспечения. Вносится масса искусственных ограничений совместимости программных продуктов, на уровне форматов файлов и ревизий их реализации. Практически не упоминается стандартизация так таковая. Интерфейсы программ для работы с DICOM файлами очень громоздки и практически не настраиваемые. Не говоря о том, что все они построены на крайне медлительных и громоздких JAVA платформах (в попытке добиться кросплатформенности, вместо того, чтобы развивать параллельно программы для нескольких операционных систем, базируясь на их нативных средах разработки. А то что компании разработчики выпускают для проприетарных операционных систем не всегда совместимо с этими же операционными системами. То, что в медицинских программах практически отсутствуют настройки интерфейса и самого основного Workflow (рабочего процесса), заставляет задумываться о постоянном поиске более удобной альтернативы.

Посмотрим в сторону альтернативных операционных систем (ОС) и медицинского программного обеспечения?

Бесплатно распространяемые коммерческие вьюеры (просмотр файлов .dcm).


Программы, записанные на компакт во время обследования на диск с данными.


Самые распространенные программы для просмотра томограмм, поставляемые вместе с компьютерными томограммами:
Они стабильно работают под управлением Windows XP & 7 (32&64-bit).
NB. Очевидцы потерпевшие уверяют, что легендарное творение гуано 10 версии от MS не поддерживает Ez3D 2009, Vatech, производители Planmeca Romexis разослали пользователям письма, ключевая фраза открытым текстом "Никогда Не Запускать под windows 10!". Прогресс закончился регрессом...
На деле, со временем, MS очевидно пропатчив свой программный продукт, добилась относительно устойчивой работы

Ez3D 2009, Vatech


Ключевые особенности:

Ez3D 2009, программа для просмотра КЛКТ, ключевые особенности программы>

  • Может работать не только с CD-R, а и с облачными сервисами, с данными, записанными на флешку (USB-device) (и это очень большой плюс);
  • Создает многослойные реконструкции (MPR);
  • Создаёт ортопантомограммы;
  • Позволяет расположить модели имплантатов;
  • Есть возможность достаточно точных измерений и сохранение (импортирование) результатов измерений в формате .jpg>, с последующей демонстрацией пациенту или коллегам, с пересылкой по электронной почте и пр.

    Использование программного обеспечения Ez3D 2009 в стоматологии.


    Программное обеспечение Ez3D 2009 находится на компакт-диске вместе с данными компьютерного обследования, после инсталляции Ez3D 2009 возможна полноценная работа с аналогичными данными других обследований.
    Последовательность действий. Предварительно скопируйте необходимые папки и файлы с компакт-диска в созданную на винчестере директорию.
    Например Создаем Папку 01.02.201*. В неё (с компакт-диска) копируем только папку /DATA, файлы SUID.ini и Launcher.exe. Всё!
    Извлекаем CD, стартуем программу с винчестера, Launcher.exe. Приятной работы. Преимущества - значительно бОльшая скорость работы программы, экономия ресурса лазерного дисковода.
    Из минусов программы:
  • нет возможности сохранить в бесплатном вьюере результаты рисования и позиционирования имплантантов :(
  • красивая полная функциональность программы - в платной версии.

    Новая версия программы программное обеспечение от Vatech America

    Planmeca Romexis



    Planmeca Romexis - особенности программы>Особенности - см. выше. Стоимость eu 2000.
    Дополнительно:

    • Полная поддержка операционных систем Microsoft Windows и Apple Mac OS

      Серьезные недостатки:


      • Открывает томограмму только 1 пациента; (ИМХО производителя - это преимущество, не перепутаешь пациентов!)
      • Высокие аппаратные требования для комфортной работы;
      • Низкая стабильность работы при длительном использовании;
      • Отсутствует функция сохранения измерений;
        Сайт производителя Planmeca Romexis и бесплатный вьюер
        И тут: DICOMscope

        Aeskulap 0.2.1


        Aeskulap Aeskulap - 0.2.1 свободный продукт, давно не поддерживается (2006-2007гг).
        Win-версия Попробуйте линукс-версию тут, много и под разные виды пингвинов - Linux Download-link
        MultiVoxDICOM
        MultiVoxDicomViewer
        Россия, программа для работы с КТ. Не впечатлило, только для компьютерной томографии (но не для стоматологии, увы...).

        MultiVox DICOM - возможности программы:> Свободно распространяемая программа MultiVox DICOM Viewer обладает следующими возможностями по работе с DICOM изображениями:

      • Импорт DICOM CD
      • Импорт DICOM файлов и DICOM каталогов
      • Импорт изображений через DICOM Query/Retrieve (поддерживаются как C-Get, так и C-Move операции) c PACS серверов сторонних производителей
      • Импорт изображений в форматах JPEG, PNG, BMP, TIFF
      • Экспорт файлов в формате JPEG, PNG, BMP, TIFF
      • Просмотр изображений в полноэкранном режиме
      • Произвольная разбивка экрана
      • Отображение взаимных пересечений срезов изображений (scout lines)
      • Отображение проекции точки на плоскости изображений (3D курсор)
      • Автоматическая раскладка изображений и расширенные настройки пролистывания изображений
      • HQ-интерполяция высокого качества для изображений, размеры которых значительно превышают разрешение экрана ПК
      • Преобразования интенсивности с поддержкой линейных, экспоненциальных, логарифмических и S-образных кривых с возможностью наложения цветовой карты от синего к красному
      • Преобразования геометрии изображения
      • Измерения
      • Линия
      • Ломанная
      • Кривая
      • Прямоугольник
      • Эллипс
      • Область внутри ломанной
      • Область внутри кривой
      • Угол и др.
      • Расчет среднего значения интенсивности и дисперсии в области измерения
      • Статистические методы: гистограмма, срез интенсивности и распределение интенсивности по времени (перфузия)
      • Ввод текста на изображениях

        Сайт
        161Mb Win7-64Slicer
        Slicer построен и испытан на многих аппаратных и программных платформ. 3D Slicer работает на Microsoft Windows XP, Vista и Windows 7; Mac OS X версии 10.5 (Leopard), 10.6 (Snow Leopard) и 10.7 (Lion), наверное будет работать и на Maverik а также различные дистрибутивы Linux.
        Предпочитает 64-битные системы.
        Библиотека изображений: сайт Surgical Planning Laboratory
        release of Slicer 4.6
        Личные впечатления:

        1. При первом запуске программа заявила, что она не предназначена для использования в клинических условиях. Интересно, наверное в домашних условиях, на досуге, какие-то озабоченные своим здоровьем маньяки пользователи рассматривают свои томограммы.
          Для кого нужна такая программа, если данные и файлы, открытые в ней нельзя применять в медицине?
        2. Программа ОЧЕНЬ медленно работает.
        3. Показал ей на компакт-диске папку с записанными файлами .dcm - длительное импортирование данных с принудительным завершением процесса,
        4. в надежде, что программа будет резвее работать я скопировал данные на винчестер, импортировал базу данных из папки и скормил программе. Долгое молчание, долгое шуршание винта, тишина....
          Попытки расшевелить программу длились в различных вариациях несколько часов...

          Благополучно деинсталлирована. ИМХО - Must die!

        DicomWorks


        Тестировалась версия 1.3.5.
        Инсталляция, сообщения о найденных ошибках, запущена в режиме совместимости с Windows ХР. Обычный просмотрщик .dcm в аксиальной проекции, таких в сети немерянно. Некоторые функции - измерения расстояния, угла, выбор цвета фона... Скучновато...
        Проект закрылся в 2011. Сайт не работает, просят денег на разработку...

        Стандартные программы free software под Windows.


        XnViewMP
        Version 0.56 (Jun 10 2013)
        Позволит с успехом просмотреть серию файлов .dcm (но только в аксиальной проекции, как и большинство "специализированных" программ в Win/Lin, можно пользоваться и монстрами для графики PhotoShop & vs GIMP, но это уже слишком нагрузит операционку, цель не оправдывает средства...).
        XnView. Это единственная бесплатная программа - просмотрщик (viewer), которая открывает файлы формата .dcm,
        Picasa - к моему огромному сожалению Picasa (очень удобная штука для просмотра, каталогизации и достаточно количества плагинов для обработки фотографий) - не работает с .dcm,
        FastStone не работает с .dcm.
        Йесс, нашел!

        Программа для бесплатного просмотра КЛКТ: Agnosco - Free DICOM Viewer


        Линк на слив и сайт программы Latest version is 2.3.5 from October 13, 2011Agnosco
        Agnosco
        Бесплатная программа под Win. После экспорта директории с дата-файлами стороннего (Ez3D 2009) КЛКТ всё прекрасно смотрится в нескольких проекциях, выбираешь сам - где какая цветовая схема, предустановки контрастности-яркости под различные плотности тканей организма, работает функция измерения, измерение расстояния, определение угла, возможна вставка текста непосредственно в сохраняемый файл-рисунок, редактирование и внесение стрелок для акцентирования внимания.

        Владельцам Mac-ов


        Сторонникам Apple можно разрешить попробовать проблему через Parallels Desktop (платный продукт, как и всё для Маков), тестеры утверждают, что скорость программы 3Д-визуализации якобы заметно ниже, чем на нативной машине с Windows, фаны MacOS заверяют, что всё в полном порядке, всё просто летает :P. Не верю. Может и работает, с тормозами и глюками, но не летает.


        Почему? ИМХО:

        На компьютере крутится 2 операционки, пожирая память + достаточно ресурсоемкая программа анализа и обработки КЛКТ... Сторонники надстроек, виртуалок и эмуляторов могут сколько угодно брызгать слюной, но вряд ли они будут возражать правоте (цинизму) фразы «Боливару не снести двоих». Одной лошадиной силе нести 2-х седоков минимум в 2 раза сложнее. И как зовут лошадь - Боливар, Винда, Линукс или МакОсь - по сути неважно, ваш компьютер работает с низким КПД. А работать на iMac через использование Apple BootCamp или виртуальной машины, вроде Parallels (Parallels Desktop for Mac) или Virtualbox с программами для Windows...cool!!
        Второй путь - Wineskin, порт известного линуксоводам Wine. Работает не со всеми программами.



        Linux-like


        Линукс хороша своими фришными программами - я лично монтировал и редактировал фильмы, работал с программами 3D-моделирования и графическими редакторами, обрабатывал цифровые фотографии в аналогах Лайтрум и Фотошоп. На достаточно скромном Acer 1692 WLMi, добавив до предела оперативной памяти и под Линукс Минт 14, рендерилось видео, обрабатывалась фотосессия, одновременно прекрасно редактируется именно эта статья.
        Но вот чего нет в Линуксе - это корректной работы с КЛКТ-гляделками, именно фирменными, прописанными на компакте с результатами КЛКТ. Это решаемо, через VirtualBox, установку Windows, установку программ для КЛКТ. Работает, достаточно медленно, нещадно пожирая ресурсы компьютера... Через Wine не работает (или работает коряво-медленно.
        В Линуксе есть достаточно большое количество бесплатных программ для работы с файлами .dcm, для чтения КТ (не КЛКТ, подчеркиваю этот прискорбный факт), но ни одна из них не позволит вам визуализировать в 3 проекциях и воссоздать 3D-изображение. У_В_Ы!
        Можно найти компромисс, в виртуальной среде (Oracle VM VirtualBox) инсталлировать Windows, под ней проинсталлировать программу для КЛКТ, дополнительно - какой-либо графический редактор для работы с сохраненными изображениями...
        Посему Линукс оставим "для творческой натуры и для души", а заурядную работу с компьютерными томограммами нужно всё же взвалить на "бизнес-ОS- Windows". Желательно, на мощной тачке, с шустрым процессором, быстрой видеокартой и памятью.
        Се ля ви.

        Программы КЛКТ для ортодонтии, имплантологии, пластической и реконструктивной хирургии.


        Но не всё так плохо, под Wine прекрасно работает iCATVision, предназначение данной программы - анализ КЛКТ, правда, достаточно узконаправленно - для ортодонтии, имплантации, пластической хирургии, ЛОР.
        Особенности программы - быстрое сканирование, визуализации твердых тканей и костных структур с максимальной детализацией и контрастностью. Но... назначение программы - пластическая и реконструктивная хирургия, ЛОР, имплантология, ортодонтия. Для эндодонтии непригодна.
        Сайт разработчиков Как работает Линукс с программным обеспечением для компьютерной томографии

        ----------------- Линукс и виртуальные машины для работы с КЛКТ, Клоны windows на виртуальной машине под Линукс для работы с результатами компьютерной томографии в стоматологической практике